Luoston länsipuolella avautuvat puiston laajimmat aapasuot, mm. Siurunaapa ja Joutsenenpesäaapa.
Kansallispuistossa on myös rinnesoita, esimerkiksi Peurakeron pohjoispuolella.
Aapasoita rikastuttavat monet lähteet, purot, joet ja lammet. Niiden ja avovesirimmikoiden muodostamat kosteat elinympäristöt suosivat hyttysiä, ja ylläpitävät runsasta ja monipuolista linnustoa.
Suot ovat paitsi joutsenten ja metsähanhien pesimäpaikkoja, myös kahlaajien ja petolintujen valtakuntaa. Esimerkiksi tuulihaukan tai suopöllön voi nähdä soiden yllä saalistamassa. Tyypillisiä kahlaajia ovat mm. liro, suokukko sekä jänkäkurppa.
Kevät ja alkukesä ovat parasta aikaa lintujen seuraamiseen. Merkityillä reiteillä pysyminen varmistaa pesimärauhan soiden asukkaille.
Kasveista peruslajistoon kuuluvat mm. nevojen erilaiset sarat ja suovillat, rämeiden hilla ja huumaavan tuoksuva suopursu sekä korpien metsäkorte. Rehevien lettojen erikoisuus on kauniin keltaisena kukoistava lettorikko, joka on rauhoitettu.

101:{"value":"public://2024-05/PyhaLuosto_luonto_Siurunaapa_kesayona_JuhaPaso.jpg","url":"/sites/default/files/2024-05/PyhaLuosto_luonto_Siurunaapa_kesayona_JuhaPaso.jpg"} 102:{"large":"https://luontoon-fi-cms-production.druid.fi/sites/default/files/styles/large/public/2024-05/PyhaLuosto_luonto_Siurunaapa_kesayona_JuhaPaso.jpg?h=22b70206&itok=VKt-woPL","medium":"https://luontoon-fi-cms-production.druid.fi/sites/default/files/styles/medium/public/2024-05/PyhaLuosto_luonto_Siurunaapa_kesayona_JuhaPaso.jpg?h=22b70206&itok=XLzmwEj9","thumbnail":"https://luontoon-fi-cms-production.druid.fi/sites/default/files/styles/thumbnail/public/2024-05/PyhaLuosto_luonto_Siurunaapa_kesayona_JuhaPaso.jpg?h=22b70206&itok=qPScSs1l"} 104:{"href":"https://luontoon-fi-cms-production.druid.fi/fi/jsonapi/file/file/4efe4fd3-f772-4fac-9360-4476e809cfd8"} 103:{"self":"$104"} 105:T42e,Pyhätunturi ja Luosto muodostavat Suomen eteläisimmän suurtunturialueen. Rakkakivikon