Erämaa-alueen lammissa ja järvissä voi kalastaa maksutta onkimalla ja pilkkimällä. Yhdellä vavalla kalastaminen lammissa ja järvissä on sallittu kalastonhoitomaksulla. Virtaaviissa vesissä viehekalastukseen tarvitset vapaluvan. Vapalupa-alueita Hammastunturin erämaassa ovat mm. Hammastunturi - Tsarmitunturi, Ivalojoki-Kuttura, Ivalojoki, Toloskoski-Appisjokisuu, Tolosjoki ja Sotajoki. Alueen kalastusta ohjaa Inarin kalatalousalueen kalastussääntö, josta löytyy rauhoitetut alueet ja rauhoitusajat.