Till sina allmänna drag är skogarna på Ärjänsaari fullvuxen jämgammal åstallskog på sandmo, vars vanligaste vegetationstyper är lingon-blåbärstyp och kråkbär-lingontyp.

Skogarna har behandlats flera gånger, men tiden och freden ökar skogarnas mångfald och naturtillstånd. De senaste avverkningarna på ön gjordes 2016, då gallrings- och luckhuggning gjordes på cirka 65 ha.

Det vanligaste trädslaget på Ärjänsaari är tall. Den sandiga jordmånen gör att skogarna även i fortsättningen kommer att domineras av tall, där ståtliga gamla träd berikar landskapet.

Det förekommer väldigt lite gran. Gråal, vårtbjörk och asp förekommer särskilt i de frodigaste områdena, särskilt i lundområdet kring den gamla cafébyggnaden. Några små myrområden finns också på öns östra och södra delar.

Som motvikt till de karga åsskogarna på öns inre del förekommer i omgivningen kring den gamla cafébyggnaden en mullhaltig, grundvattenpåverkad lövträdslund.

Där trivs bland annat trolldruva, tibast, vårärt, vispstarr och skogsvicker. I lundområdet förekommer lövträdstickor, i synnerhet björktickearter.
Sådana är bland annat platticka, kuddticka, eldticka, svedticka, björkmussling, sprängticka, fnöskticka, björkticka, slingerticka, zonticka. Detta vittnar om att ett kontinuum av död björkved har börjat bildas i lundområdet.

En preliminär kartläggning av artbeståndet för tickor har gjorts i lundområdet kring caféet och längs stigarna. Indikatorarter för gammal skog som observerats på ön är kötticka samt tallticka, som förekommer allmänt i öns gamla tallar.

74:{"value":"public://2025-01/Arja2_Kuva_Ilkka_Immonen.jpg","url":"/sites/default/files/2025-01/Arja2_Kuva_Ilkka_Immonen.jpg"} 75:{"large":"https://luontoon-fi-cms-production.druid.fi/sites/default/files/styles/large/public/2025-01/Arja2_Kuva_Ilkka_Immonen.jpg?h=0722f989&itok=O_zoMJPl","medium":"https://luontoon-fi-cms-produ

Med tåg, buss eller flyg.