Saaristomeren kansallispuisto sijaitsee Varsinais-Suomessa Turunmaan saariston eteläreunalla. Kansallispuistoon pääseminen edellyttää merimatkaa. Lähimmät yhteysalussatamat sijaitsevat noin 70 km Turusta Nauvon Pärnäisissä ja noin 180 km Helsingistä Kemiönsaaren Kasnäsissä. Ruuhkaisinta on erityisesti losseilla viikonloppuisin kesä-elokuussa, arkisin on yleensä hyvin tilaa. Yhteysalussatamiin pääsee autolla. Satamien yhteydessä on yleensä valtion ilmaisia pysäköintialueita ja yksityisiä maksullisia paikkoja.