Erämaa-alueen lammissa ja järvissä voi kalastaa maksutta onkimalla ja pilkkimällä, poislukien eritysvedet. Yhdellä vavalla kalastaminen lammissa ja järvissä on sallittu kalastonhoitomaksulla Eraluvat.fi. Erityisvesissä tarvitsee lisäksi vapaluvan. Virtaaviissa vesissä viehekalastukseen tarvitset vapaluvan. Vapalupa-alueita Hammastunturin erämaassa ovat mm. Hammastunturi - Tsarmitunturi, Ivalojoki-Kuttura, Ivalojoki, Toloskoski-Appisjokisuu, Tolosjoki ja Sotajoki. Alueen kalastusta ohjaa Inarin kalatalousalueen kalastussääntö inarinkalatalousalue.fi, josta löytyy rauhoitetut alueet ja rauhoitusajat.